| 認定日 | 補助金名 | 補助金金額 | 補助金の対象 | 連名 | 補助金財源 |
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| 2017/04/01 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(牽引型) | ¥1,800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(牽引型) | ¥1,800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/10/09 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,025,539,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/10/09 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥13,505,168,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/01/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,187,091,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/01/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥12,909,633,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/01/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥57,496,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/03/07 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,427,507,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/03/07 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥4,812,587,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/03/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥200,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/12 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥12,981,305,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/12 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥650,954,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/24 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥54,308,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/05/14 | 農業競争力強化農地整備事業 | ¥20,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/05/16 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥138,584,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/05/21 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥710,970,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/06/07 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,150,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/07/08 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥10,402,687,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/07/08 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,151,869,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/07/26 | 我が国のOIE認定施設活動支援事業 | ¥3,345,040 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/08/07 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,350,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/08/07 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥90,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/10/08 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,009,514,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/10/08 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥13,612,963,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,151,867,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥12,852,529,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥347,022,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/03/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,905,139,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/03/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥5,554,283,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/03/18 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | ¥5,000,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥13,633,799,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥564,200,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/20 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥150,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/20 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥540,197,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/27 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥21,563,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/27 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥593,750,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/27 | 国立研究開発法人農業食品産業技術総合研究機構農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥757,657,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/05/28 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | ¥100,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/05/28 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥145,902,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/06/19 | 我が国のOIE認定施設活動支援事業 | ¥1,505,800 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥10,828,164,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥21,562,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥593,750,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥937,295,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/08/28 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥43,639,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/10/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥13,305,599,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/10/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥564,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/10/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥71,187,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/10/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥771,082,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/11/12 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥192,898,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/11/17 | 世界で活躍できる研究者戦略育成事業 | ¥800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/01/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥15,943,958,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/01/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥3,275,909,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/01/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥434,584,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/01/13 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥564,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 世界で活躍できる研究者戦略育成事業 | ¥500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥122,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥13,810,097,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | ¥160,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥503,250,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥619,717,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/25 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥954,675,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/05/13 | 国立研究開発法人農業食品産業技術総合研究機構農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥837,043,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/05/20 | 家畜衛生対策事業 | ¥2,227,954 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/03 | 持続的生産強化対策事業/ジャパンフラワー強化プロジェクト推進 | ¥20,923,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/20 | 農林水産データ管理・活用基盤強化事業 | ¥123,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/07/19 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥10,561,403,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/07/19 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥122,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/07/19 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥703,250,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/07/19 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥860,660,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/08/15 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥194,622,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/08/23 | スマート農業等の海外展開に向けた標準の戦略的活用 | ¥80,784,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/01/10 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥519,800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/01/30 | 世界で活躍できる研究者戦略育成事業 | ¥100,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/03 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥100,864,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/14 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,640,664,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/14 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥23,516,467,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/19 | 国立研究開発法人農業食品産業技術総合研究機構運営費交付金農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥462,254,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/26 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | ¥160,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/27 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥1,005,444,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/05/11 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥146,168,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/05/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基礎的研究業務勘定運営費交付金 | ¥1,085,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/05/31 | 家畜衛生対策事業/我が国のOIE認定施設活動支援事業 | ¥2,439,932 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/06/15 | 農林水産データ管理・活用基盤強化事業 | ¥109,991,300 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/07/28 | 国立研究開発法人農業食品産業技術総合研究機構運営費交付金農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥343,310,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/22 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構農業技術研究業務勘定運営費交付金 | ¥209,950,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/09/04 | 国立研究開発法人農業食品産業技術総合研究機構運営費交付金農業機械化促進業務勘定運営費交付金 | ¥26,667,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/12/11 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構施設整備費補助金 | ¥570,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/12/21 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | ¥2,000,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2024/04/01 | 地域共創・セクター横断型カーボンニュートラル技術開発・実証事業 | ¥19,574,000 | -------- | -------- | -------- |