| 認定日 | 補助金名 | 補助金金額 | 補助金の対象 | 連名 | 補助金財源 |
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| 2017/04/03 | 文化財関係補助事業 | ¥1,828,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/12/25 | 与那国駐屯地周辺ごみ処理施設(焼却施設)整備助成事業(その1) | ¥1,259,156,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/25 | 河川等災害復旧事業 | ¥2,316,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 国宝重要文化財文化財等保存整備事業 | ¥2,647,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/07/25 | 与那国駐屯地周辺道路(樽舞1号線外2)改修等事業 | ¥21,046,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/09/02 | 国宝重要文化財文化財等保存整備事業 | ¥33,336,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/10/07 | 与那国駐屯地周辺ごみ処理施設(焼却施設)整備助成事業(その2) | ¥815,330,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/10/15 | 令和元年度沖縄製糖業体制強化対策事業費補助金 | ¥295,140,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/11/01 | 国宝重要文化財文化財等保存整備事業 | ¥-14,040,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/11/01 | 令和元年度沖縄人材育成事業費補助金(ICTを活用した離島における遠隔教育の実証 | ¥6,739,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/12/20 | 令和元年度 沖縄離島活性化推進事業費補助金(与那国町)の交付決定の変更に伴う額の変更 | ¥4,400,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/03/04 | 河川等災害復旧事業 | ¥20,726,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/22 | 与那国駐屯地周辺道路(樽舞1号線外2)改修等事業 | ¥83,703,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/10/05 | 沖縄観光防災力強化支援事業費補助金 | ¥2,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/03/05 | 与那国駐屯地周辺ごみ処理施設(焼却施設)整備助成事業(その3) | ¥16,912,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 国宝重要文化財文化財等保存整備事業 | ¥16,019,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/06/03 | 沖縄観光防災力強化支援事業費補助金 | ¥13,460,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/06/30 | 与那国駐屯地周辺総合食育センター(学校給食)整備助成事業(実施設計) | ¥12,134,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/07/02 | 令和3年度沖縄離島活性化推進事業費補助金(与那国町) | ¥8,160,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/09/30 | 与那国駐屯地周辺道路(樽舞1号線外2)改修等事業 | ¥76,170,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 国宝重要文化財文化財等保存整備事業 | ¥27,780,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/07/01 | 令和4年度沖縄離島活性化推進事業費補助金(与那国町) | ¥48,248,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/10/04 | 与那国駐屯地周辺道路(樽舞1号線外2)改修等事業 | ¥70,304,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/10/12 | 与那国駐屯地周辺道路(樽舞1号線外2)改修等事業(その2) | ¥1,482,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/11/17 | 与那国駐屯地周辺総合食育センター(学校給食)整備助成事業 | ¥433,773,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/03/20 | 令和3年度(令和2年度からの繰越分)インフルエンザ流行期における発熱外来診療体制確保支援補助金(インフルエンザ流行期に備えた発熱患者の外来診療・検査体制確保事業実施医療機関支援事業) | ¥222,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/06/30 | 令和5年度沖縄離島活性化推進事業費補助金(与那国町) | ¥10,056,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/09/29 | 令和5年度沖縄離島活性化推進事業費補助金(与那国町)負担増 | ¥190,572,000 | -------- | -------- | -------- |