| 認定日 | 補助金名 | 補助金金額 | 補助金の対象 | 連名 | 補助金財源 |
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| 2017/02/13 | (明大寺)実験研究棟改修(基生研) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 大型電波顕微鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,262,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(次世代研究者育成プログラム) | ¥26,280,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥290,200,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/12 | (土岐)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2017/05/09 | 自然科学研究機構・機能強化促進費 | ¥163,429,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/05/29 | 30m光学赤外線望遠鏡(TMT)計画の推進 | ¥299,889,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,269,811,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(次世代研究者育成プログラム) | ¥22,120,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥283,300,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/12 | (明大寺)総合研究棟改修(動物実験センター) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/16 | 30m光学赤外線望遠鏡(TMT)計画の推進 | ¥545,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/27 | 自然科学研究機構・機能強化促進費 | ¥327,109,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/11/22 | (岩手県水沢)基幹・環境整備(ブロック塀対策) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,411,780,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(次世代研究者育成プログラム) | ¥22,673,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥240,412,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 平成31年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥30,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (三鷹)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (三鷹)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (土岐)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (土岐)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (山手)ライフライン再生(特高受変電設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (明大寺)総合研究棟改修(分子研) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/26 | 30m光学赤外線望遠鏡(TMT)計画の推進 | ¥3,000,526,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/26 | 遺伝子改変モデル動物研究基盤設備 | ¥479,917,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/12 | (三鷹)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/12 | (三鷹)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/20 | (土岐)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/20 | (東京都父島)災害復旧事業 | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/03/11 | (土岐)実験研究棟等改修 | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,411,780,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥232,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 令和2年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥30,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/16 | (土岐)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/16 | (明大寺)ライフライン再生(熱源設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/16 | (明大寺)総合研究棟改修Ⅱ(分子研) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/23 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究 | ¥394,940,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/06/05 | (土岐)基幹・環境整備(衛生対策) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/17 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究活動再開等のための研究設備の遠隔化・自動化による環境整備) | ¥50,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/03 | 研究大学強化促進事業 | ¥268,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/18 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究施設・設備・機器のリモート化・スマート化) | ¥139,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/22 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究 | ¥428,338,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (土岐)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (明大寺他)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (明大寺)基幹・環境整備(衛生対策等) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/03/10 | (土岐)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,411,780,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゼブラフィッシュの収集・保存および提供」 | ¥1,887,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥210,600,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「アサガオリソースの収集・保存・提供およびゲノム情報を用いた高度化」 | ¥2,866,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「メダカ先導的バイオリソース拠点形成」 | ¥33,910,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ライフサイエンス研究用ニホンザルの飼育・繁殖・提供」 | ¥76,922,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/05/20 | 令和3年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥30,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/04 | 令和3年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥-1,392,765 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究(高度化) | ¥300,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥394,516,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究(老朽化) | ¥501,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥1,411,780,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥172,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 大型光学赤外線望遠鏡による国際共同研究の推進 | ¥350,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/05 | 令和4年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥30,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゼブラフィッシュの収集・保存および提供」 | ¥1,887,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「次世代型メダカバイオリソース整備とその拠点形成」 | ¥25,560,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゲノム情報に基づいたアサガオリソースの収集・保存・提供」 | ¥2,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ライフサイエンス研究用ニホンザルの飼育・繁殖・提供」 | ¥81,220,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/09/30 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「次世代型メダカバイオリソース整備とその拠点形成」 | ¥4,510,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/01/13 | 大型電波望遠鏡「アルマ」による国際共同利用研究の推進 | ¥184,527,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/01/13 | 大型光学赤外線望遠鏡「すばる」の共同利用研究 | ¥451,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (ハワイ山麓)ライフライン再生(空調設備) | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (明大寺他)ライフライン再生(給排水設備) | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (明大寺)ライフライン再生(給排水設備) | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (沖縄県石垣2)災害復旧事業 | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/12 | 令和5年度先進的核融合研究開発費補助金(一般会計、単年度分) | ¥50,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/07 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「次世代型メダカバイオリソース整備とその拠点形成」 | ¥440,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/07 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゲノム情報に基づいたアサガオリソースの収集・保存・提供」 | ¥544,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/07 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ライフサイエンス研究用ニホンザルの飼育・繁殖・提供」 | ¥5,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/09/29 | 共同利用・共同研究システム形成事業~学際領域展開ハブ形成プログラム~(分子・生命・生理科学が融合した次世代新分野創成のためのスピン生命フロンティアハブの創設) | ¥64,000,000 | -------- | -------- | -------- |