| 認定日 | 補助金名 | 補助金金額 | 補助金の対象 | 連名 | 補助金財源 |
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| 2016/04/11 | (東海)J-PARCビーム増強施設 | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(次世代研究者育成プログラム) | ¥10,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥249,800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥9,669,205,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/12 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/12 | (大穂)基幹・環境整備(防水) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 科学技術人材育成のコンソーシアムの構築事業(次世代研究者育成プログラム) | ¥16,600,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥208,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥9,333,458,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/12 | (大穂)ライフライン再生(特高受変電設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2018/08/01 | 先端加速器の低コスト化基盤技術の開発 | ¥214,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/06 | (大穂)ライフライン再生(特高受変電設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/22 | (大穂)実験研究棟耐震改修 | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/03/13 | (大穂)ライフライン再生(空調設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥174,358,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 先端加速器の低コスト化基盤技術の開発 | ¥268,530,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥9,180,769,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/22 | (大穂)ライフライン再生(RI設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/26 | 量子ビーム照射によるアスファルト舗装道路の長寿命化等 | ¥1,342,759,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/26 | 高輝度大型ハドロン衝突型加速器(HL-LHC)による素粒子実験 | ¥180,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/12 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/12 | (大穂)ライフライン再生(RI設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/14 | 大強度実験加速器加速器加速器による実験研究 | ¥1,484,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/14 | ハイパーカミオカンデ計画 | ¥371,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥167,600,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 先端加速器の低コスト化基盤技術の開発 | ¥320,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「シミュレーションで探る基礎科学・素粒子の基本法則から元素の生成まで」 | ¥50,769,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥8,758,530,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/16 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/16 | (東海)基幹・環境整備(RI排水処理設備等) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/23 | 高輝度大型ハドロン衝突型加速器(HL-LHC)による素粒子実験 | ¥617,241,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/06/05 | (大穂)基幹・環境整備(衛生対策) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2020/07/17 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究活動再開等のための研究設備の遠隔化・自動化による環境整備) | ¥47,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/03 | 研究大学強化促進事業 | ¥5,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/18 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究施設・設備・機器のリモート化・スマート化) | ¥139,960,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/22 | 大強度陽子加速器による実験研究 | ¥2,153,600,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/22 | ハイパーカミオカンデ計画の推進 | ¥513,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (大穂)ライフライン再生(給排水設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/25 | (大穂)実験研究棟(構造系) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/03/10 | (大穂)ライフライン再生(電気設備) | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥151,800,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 大強度陽子加速器施設(J-PARC)による実験研究 | ¥1,522,400,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 先端加速器の低コスト化基盤技術の開発 | ¥320,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 高輝度大型ハドロン衝突型加速器(HL-LHC)による素粒子実験 | ¥448,759,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「シミュレーションで探る基礎科学・素粒子の基本法則から元素の生成まで」 | ¥50,769,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥8,758,530,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/23 | (大穂)長寿命化促進事業 | -------- | -------- | -------- | -------- |
| 2021/11/09 | 国際研究拠点形成促進事業 | ¥350,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/01/26 | 300kVクライオ電子顕微鏡システム | ¥454,410,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | フォトンファクトリーによる物質と生命の探究 | ¥160,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | 大強度陽子加速器施設(J-PARC)による物質・生命科学及び原子核・素粒子物理学研究の推進 | ¥292,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/02/15 | ハイパーカミオカンデ(HK)計画の推進 | ¥846,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 高輝度大型ハドロン衝突型加速器(HL-LHC)による素粒子実験 | ¥1,001,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 研究大学強化促進事業 | ¥124,100,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 先端加速器の低コスト化基盤技術の開発 | ¥320,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「シミュレーションで探る基礎科学:素粒子の基本法則から元素の生成まで」 | ¥49,135,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | スーパーKEKBによる実験研究 | ¥569,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 大強度陽子加速器による実験研究 | ¥590,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 国際研究拠点形成促進事業 | ¥750,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 高エネルギー加速器を用いた実験研究 | ¥8,758,530,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/15 | (大穂)ライフライン再生(給排水設備等) | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/15 | (大穂)富士実験棟等耐震改修 | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/01/13 | ハイパーカミオカンデ(HK)計画の推進 | ¥649,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (大穂)日光実験棟耐震改修 | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/02/17 | (大穂)災害復旧事業 | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/03 | KEK スーパーB ファクトリー計画 | ¥338,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/03 | 大強度陽子ビームで究める宇宙と物質の起源と進化 | ¥387,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/14 | 将来加速器の性能向上に向けた重要要素技術開発 | ¥700,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/20 | (大穂)量子場計測実験研究棟 | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/04/27 | スーパーコンピュータ「富岳」成果創出加速プログラム(次世代超高速電子計算機システム利用の成果促進)「シミュレーションでせまる基礎科学:量子新時代へのアプローチ」 | ¥66,943,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/05/31 | 地域中核・特色ある研究大学の連携による産学官連携・共同研究の施設整備事業 | ¥1,832,000,000 | -------- | -------- | -------- |