| 認定日 | 補助金名 | 補助金金額 | 補助金の対象 | 連名 | 補助金財源 |
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| 2017/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥10,341,765,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(Spring-8,SACLA) | ¥14,044,561,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(特色型) | ¥24,876,200 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥2,950,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備) | ¥3,854,881,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2017/11/10 | 高性能汎用計算機高度利用事業 | ¥40,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/02/01 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助事業 | ¥1,450,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/02/01 | 特定先端大型研究施設整備費補助事業 | ¥344,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/02/01 | 国立研究開発法人理化学研究所設備整備費補助事業 | ¥375,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/02/01 | 特定先端大型研究施設整備費補助事業 | ¥480,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥10,335,829,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥14,169,255,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 特定先端大型研究施設整備費補助事業 | ¥1,637,037,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備) | ¥1,821,918,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(特色型) | ¥28,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥3,051,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 高性能汎用計算機高度利用事業 | ¥44,200,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/04/01 | 特定先端大型研究施設整備費補助事業 | ¥962,963,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2018/08/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥470,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/07 | 特定先端大型研究施設整備費補助事業 | ¥1,162,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/07 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥20,860,297,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/07 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥4,435,924,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/02/07 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助金 | ¥478,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥0 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥1,234,881,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥13,864,522,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助金 | ¥2,593,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥3,051,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥7,222,292,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/07/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥4,100,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2019/10/01 | 高性能汎用計算機高度利用事業 | ¥35,188,813 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/30 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥14,400,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/30 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥1,783,604,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/01/30 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助金 | ¥1,869,020,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/18 | 令和元年度先端研究設備整備補助事業(量子技術分野) | ¥750,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/20 | 先端研究設備整備費補助事業 | ¥140,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/02/20 | 先端研究設備整備費補助事業 | ¥600,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥10,893,621,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥1,154,881,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥13,825,164,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥3,036,712,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥3,249,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「全原子・粗視化分子動力学による細胞内分子動態の解明」 | ¥35,538,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」 | ¥59,231,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/04/09 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥7,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2020/11/02 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥100,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/01/28 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助金 | ¥1,980,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/01/28 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(次世代超高速電子計算機システムの開発・整備等) | ¥32,489,074,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/02/18 | 令和2年度先端研究設備整備補助事業(研究施設・設備・機器のリモート化・スマート化) | ¥400,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥13,365,160,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥13,676,166,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゼブラフィッシュの収集・保存および提供」 | ¥21,236,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ラットリソースの収集・保存・提供」 | ¥2,866,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥3,249,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「全原子・粗視化分子動力学による細胞内分子動態の解明」 | ¥35,538,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「研究用ヒト臍帯血の収集・細胞調製・保存・提供」 | ¥4,094,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」 | ¥59,231,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「細胞性粘菌リソースの収集・保存・提供」 | ¥8,217,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/01 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「広範な微生物種の迅速同定を可能にするMALDI-TOF MSレファレンスデータの構築」 | ¥9,600,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/04/13 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥7,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/09/06 | 「富岳」成果創出加速プログラム「富岳」が拓くSociety5.0時代のスマートデザイン | ¥50,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/09/06 | 「富岳」成果創出加速プログラム「富岳」を活用した革新的光エネルギー変換材料の実現 | ¥50,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/12/20 | 国庫債務負担行為に基づく国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助事業 | ¥2,600,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/12/20 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業 | ¥320,300,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/12/20 | 国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助金 | ¥975,270,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2021/12/23 | 特定放射光施設整備事業 | ¥1,006,137,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥13,676,166,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 特定先端大型研究施設運営費等補助金(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥13,837,842,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業費補助金 | ¥3,249,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「全原子・粗視化分子動力学による細胞内分子動態の解明」 | ¥34,395,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「富岳」を活用した革新的光エネルギー変換材料の実現 | ¥47,008,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「富岳」が拓くSociety5.0時代のスマートデザイン | ¥48,391,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/01 | 「富岳」成果創出加速プログラム「プレシジョンメディスンを加速する創薬ビッグデータ統合システムの推進」 | ¥58,490,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/04/12 | 次世代人工知能技術等研究開発拠点形成事業費補助金 | ¥7,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゼブラフィッシュの収集・保存および提供」 | ¥19,445,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ヒト病原ウイルスのリソース拠点の整備」 | ¥2,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | スマート農業の総合推進対策事業/データ駆動型土づくり推進事業 | ¥3,531,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/09 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「研究用ヒト臍帯血バイオリソース事業」 | ¥3,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/06/23 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ラットリソースの収集・保存・提供」 | ¥2,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/09/30 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「遺伝子材料の収集・保存・整備・提供」 | ¥4,356,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/09/30 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「シロイヌナズナ/植物培養細胞・遺伝子」 | ¥4,500,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | HPCIのストレージ高度化事業 | ¥1,249,950,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 令和4年度国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助事業 | ¥1,370,820,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 令和3年度国庫債務負担行為に基づく国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助事業 | ¥2,300,000,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 特定先端大型研究施設運営費等補助金(特定高速電子計算機施設の運営) | ¥2,916,190,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 特定先端大型研究施設運営費等補助事業 | ¥3,429,147,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 令和4年度国庫債務負担行為に基づく国立研究開発法人理化学研究所施設整備費補助事業 | ¥350,700,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2022/12/02 | 令和4年度国立研究開発法人理化学研究所設備整備事業 | ¥4,654,400,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/07 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「ゼブラフィッシュの収集・保存および提供」 | ¥3,718,000 | -------- | -------- | -------- |
| 2023/08/07 | ナショナルバイオリソースプロジェクト「一般微生物のバイオリソース整備事業」 | ¥7,894,000 | -------- | -------- | -------- |